京东自营和京东官方旗舰店之间主要有3个地方的区别，分别是仓储的区别，是到货速度的区别，营业收入归属的区别。
仓储的区别
自营产品相当于京东从供应商采购商品，储存在自己的仓储中心里面，然后放在平台上售卖。而京东官方旗舰店是第三方商家在京东平台上开设的店铺，有商家自己运营，商品储备在商家自己的仓库里面。
到货速度的区别
在京东自营店买过东西的朋友都知道，京东自营到货速度是非常快的。一般晚上11点前下单，第二天早上就能收到了。如果是早上9点之前下单，大概下午就能收到了。
京东在全国有七个仓储物流中心，覆盖每一个城市、乡镇、村庄。无论你在国内的哪个地方，只要在京东自营下单后，系统会自动选择离你收货地址最近的仓储中心，就近发货。
京东物流体系分为三个部分，分别是中小件物流、大宗物流、冷链物流。根据宝贝性质来决定什么性质的物流配送。比如买的是大宗货物，会有专门的大件物流部负责配送，送货上门、开箱验货等服务。
营业收入归属的区别
京东自营店铺的营业收入是归京东公司的，而官方旗舰店收入是归商家的。
另外京东自营还有一个好处就是，退换货方便。收到商品的7天内，不满意的，可以直接在后台发起退换货申请就行了，预约京东快递上门取件寄回去，非常方便。
